組長：簡昭群（聯絡電話：02-37073060）
副組長：李珮芸（聯絡電話：02-37073061）
簡任正工程司：李如晃（聯絡電話：02-37073065）
第一科：科長馬家驎（聯絡電話：02-37073090）
一、地面水、地下水與近海水文計畫之研擬及督導。
二、地面水、地下水與近海水文站網之建置及維護。
三、地面水、地下水與近海水文資訊之收集、分析及利用。
四、水文研究分析及審查。
第二科：科長吳明哲（聯絡電話：02-37073080）
一、地下水補注計畫之研擬及督導。
二、抗旱水井及其潛勢區資料蒐集、彙整及分析。
三、水利產業(海淡水、再生水、微(小)水力與水域型太陽能光電等)發展策略與輔導之擬定及推動。
四、深層海水資源開發技術之推動。
第三科：科長陳芳瓊（聯絡電話：02-37073070）
一、地理資訊系統發展策略。
二、地理資訊系統之規畫建置維護及管理。
三、地理資訊系統資料格式標準及技術規範研討系統開發事項訂定。
四、水文資訊相關資料庫維護管理及資料提供。