依據行政院太陽光電2年推動計畫，水利署除於台灣本島外，也積極應運金門及澎湖地區日照充足優勢，擇適當的水庫推展水域型太陽能發電計畫，預估年發電量可達802.5萬度，朝綠能低碳目標邁進。
金門及澎湖地區有豐富的觀光資源，為保護良好的環境，地方政府也以低碳島的目標規劃相關措施。水利署考量金門及澎湖地區的日照優勢，在不妨礙蓄水功能、不影響景觀的條件下，發展水域型太陽能發電系統。其中，金門地區預定於金湖、山西及陽明湖水庫設置水域型太陽能發電系統，規劃設置容量為2.12百萬瓦，預估年發電量可達265萬度，可供應約730戶家庭用電所需。而台水公司則配合政策與台電公司合作，規劃於澎湖縣成功、興仁及東衛水庫，設置容量達4.3百萬瓦之水域型太陽能發電系統，預估年發電量達537.5萬度，可提供約1,480戶家庭用電所需。
水利署表示，兩地區均以107年6月併聯發電為目標，水域型太陽能發電系統併聯發電後，將可提供澎湖及金門地區更多的綠色能源，讓離島朝低碳觀光目標邁進。未來招商，也希望有興趣的廠商踴躍參與，共同為低碳生活齊心努力。
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