1.地下水：由取水地點所在的之縣市政府受理。
2.地面水：引水地點之地面水水系如果只流經單一縣市，則向該縣市政府申請水權（例如花蓮溪主支流只流經花蓮縣，故其地面水水權係向花蓮縣政府申請），其餘跨縣、市之水系由經濟部受理【每個月引水量在1cms（立方公尺／秒）以下，向水利署北、中、南水資源局提出申請，1cms(含)以上者應向水利署申請】。
3. 以上水權申請之相關詳細資訊（如申請流程、書面表單、受理單位聯絡方式等等）已載於水權資訊網站（網址：https://wr.wra.gov.tw/ ），歡迎您多加利用。
如果您仍有相關申請問題，可直接向各水權主管機關詢問各單位聯絡資料
聯絡單位：水源經營組五科
聯絡人：黃詩評
聯絡單位電話：04-22501670