本次中颱凡那比帶來的強風驟雨造成南台灣淹水災情，水利署表示現階段的首要任務以救災及災區復健工作為主。至於各界關注造成北高雄市地區淹水主因為何？水利署表示，雖然高雄市區已完成9成多之雨水下水道系統（設計排洪標準為5年），但此次豪大降雨量達200年頻率，因此高雄市的雨水下水道系統無法容納，且瞬間豪雨驟降造成高雄市區內愛河沿岸抽水站部分抽水機組遭淹沒無法運轉，也是另一原因。
水利署指出，大高雄地區有二大排水貫穿流經，分為後勁溪排水及愛河，後勁溪排水以楠梓區及仁武鄉為分界點，分屬於高雄市及高雄縣政府管轄；愛河屬於高雄市轄管排水，據暸解，內政部營建署亦將於易淹水計畫編列2.5億元的預算協助進行改善。屬中央管排水的典寶溪排水，雖然在凡那比颱風豪雨期間造成橋頭、梓官鄉等地區嚴重淹水，但其溢淹範圍並未擴及高雄市楠梓區。
水利署進一步表示，後勁溪排水流域屬高雄縣政府轄管部分之主、支流排水，已由第六河川局透過「易淹水地區水患治理計畫」編列經費32.83億元辦理排水渠道整治工程 (含瓶頸橋樑改建)，目前已完工6件，另有4件施工中及測設發包中3件。此項整治工程將原本不足2年保護標準之排水斷面拓寬濬深，提升保護標準至25年不溢堤。雖然本次颱風來襲，短時間豪大降雨造成仁武鳥松地區淹水，但情形已較往年減輕，大部分淹水高度約為30~50公分，且於20日清晨6時前即已退水。
雖然本次凡那比919港都水患出現部分對於中央治水不利的質疑聲浪，水利署仍表示，對於治水工作會虛心檢討外更求持續進步，並籲請地方政府也能了解中央與地方治水工作是不可分的，請先抛開誤會共同進行救災重建，該署將秉持中央地方施政一體的理念持續努力，務求以最快速時間完成救災及重建工作。
水利署發言人：吳副署長約西
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