河防安全與防洪治理是河川分署的主要任務，惟各項公共工程，除資訊公開及作業程序透明外，並期望透過與警政、司法、廉政與行政機關三方跨域合作、定期橫向聯繫，以提升整體行政效能，營造健康透明採購環境，達成水利建設廉明政府目標。