有關排水之申請，非本分署業管權責，如有需求，仍請報經各該目的事業主管機關核准。依據排水管理辦法第2條規定，區域排水依其流經之行政轄區範圍或所佔比例，區分為中央管、直轄市管及縣（市）管區域排水。農田、市區及事業排水之管理，由目的事業主管機關依其法令管理之；其他排水，由各直轄市、縣（市）政府制（訂）定自治法規管理之。