
卑南溪發源於中央山脈卑南主峰,主要支流有鹿野溪、鹿寮溪、萬安溪,流域面積1,603.21平方公里,主流長度84.35公里,流經區域為台東縣:海端鄉、池上鄉、關山鎮、鹿野鄉、延平鄉、卑南鄉及台東市。
台東海岸屬侵蝕性海岸,侵蝕現象甚為普遍,大部份海岸皆受到海潮,波浪之侵蝕而退縮,沿海居民農漁業參半,養殖業則於近年興起,以養殖九孔,龍蝦為主。海岸總長約為 172 公里。另包括綠島地區海堤及保護工5處,蘭嶼地區海堤及保護工4處,金門地區海堤及保護工共13處。
工務科:掌理工程之勘測、設計施工、工務行政及監工等事項。經辦:中央管河川堤防新建、河海堤養護、歲修、災害修復工程、前瞻計劃執行控管業務、以及防汛志工等業務。
規劃科: 一、中長程及年度業務計畫之彙整。二、河川治理和海岸之調查規劃、治理計畫之擬訂與檢討。三、水道治理計畫線與用地範圍線之劃定及調整變更。四、各項水文與地下水觀測站之維護、管理、資料蒐集、統計分析及成果報告編撰。五、防汛與洪水預報資料之蒐集、統計及陳轉。六、其他有關規劃事項。
管理科:一、經管河川區域、海堤與區域排水設施範圍使用申請案之受理、審核、許可、廢止及撤銷。二、經管河川區域、海堤、區域排水設施範圍之巡防與違法案件之查報、取締及處分。三、經管河川、區域排水疏濬工程計畫之擬訂、提報及執行。四、經管河川、海堤與區域排水空間之利用及維護管理。五、經管河川區域、海堤區域與區域排水設施範圍之管理、勘測、劃定及調整變更。六、經管河川、海堤與區域排水水門之維護操作及管理。七、抽水機組之運轉、調度及支援。八、愛護河川、排水、海岸及防汛之宣導。九、經管河川、海堤區域與排水設施範圍之人民陳情、訴願、訴訟案件查處事項。十、經管河川申請種植植物案件之許可證核發事項。十一、其他有關河川、海堤及區域排水管理事項。十二、其他臨時交辦事項。
秘書室:一、印信典守及文書、檔案之管理。二、議事、出納、財物、營繕、採購及其他事務管理。三、工友(含技工、駕駛)之管理。四、不屬其他各科、室事項。
政風室:依法辦理有關政風法令、擬訂宣導、機密維護、員工貪瀆不法預防、發掘及處理檢舉以及政風興革建議等事項。
人事室:依法辦理有關人事行政各項業務。
主計室:依法辦理歲計、會計、統計等事項。