石岡壩受921地震影響，壩體抬升平均約10公尺高，造成河床坡降緩和，部份砂石因上游洪水浹帶沉淤蓄水區內，管理中心平均每年利用機械挖採方式清淤約40~50萬立方公尺，增加水庫沉淤空間提高水質，維持正常供水，並延長水庫使用壽命。