北宜高速公路坪林行控中心專用道自民國95年開放以來，在臺北水源特定區管理分署、交通部高速公路局、新北市政府、臺北翡翠水庫管理局、新北市坪林區公所、新北市坪林區農會等相關單位組成之「共同管理協調會報」，政府單位代表、專家學者及非政府組織環保團體組成「執行監督委員會」，推動多元污染預防與管理作為、緊急應變及關閉機制及各項管制事項檢討，亦長期監督區內車輛總量、環境與水質監測情形，集結眾人智慧為環境把脈。
專用道管制與監測係應用互聯網與自動科技，透過自動車輛偵測器計算每日外來車輛數，有效進行控管及提升管理效率、設置24小時自動水質監測站，掌握水質即時變化，加上各機關的相關污染預防措施，自污水下水道、淨化槽、植生滯留槽、農藥肥料使用宣導與抽檢、露營業者污水處理宣導及協助，到友善環境生態的廢棄農藥容器回收等政策，以及密切的與當地民眾進行良善交流，正向積極回應民眾訴求，讓臺北水源特定區成為全臺流域管理示範區，也讓潔淨的水源持續地維持，傳承給下一代。
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