石門水庫至新竹聯通管工程計畫屬輸水管線工程，可將石門水庫多餘原水透過該輸水管線串接至寶二水庫，支援新竹地區每日最大30萬噸之緊急供水備援能力，該管線全長約25公里，橫跨桃園市龍潭區、新竹縣關西鎮、橫山鄉及竹東鎮等，工程於由石門水庫中線鋼管經由隧道方式穿越石門山，於台三線及竹28-1道路透過明挖埋設或推管方式將管線延伸至寶二水庫引水渠道。另輸水管線需橫跨頭前溪、油羅溪等大小河川部分，則設置9座水管橋，工程於無自來水地區將併埋自來水管線。
在用取得上，南區水資源分署(以下簡稱南水分署)按工程性質，採取得所有權或設定區分地上權方式辦理，自112年3月起陸續辦理8場公聽會、7場協議價購會議，透過多次會勘、拜訪及研商等形式，邀私有地主洽商價購、設定區分地上權等事宜。在土地補償部分，南水分署並委託專業之不動產估價師評估土地市價，以確保私有土地地主權益，為提高協議價購意願，並承諾達成協議價購者，倘核定之徵收價格高於協議價格時，願意補償其差額，最終未能透過協議取得部分，才申請土地徵收。本計畫共計取得或設定區分地上權之私有土地計143筆，面積約7.3公頃，涉及之私有地人數共429人，協議價購之面積約為4.9公頃，比例約為67%，用地取得期間未曾有抗爭致影響計畫推動情事發生。
本計畫已於113年4月間陸續展開工程施作，全線預計117年底前竣工，完工後將進一步鞏固新竹地區的供水韌性，並帶動區域生活條件的提升。