隨著全球水資源日益短缺，海水淡化已成為重要的解決方案，經由RO逆滲透技術將海水過濾後取得水質良好的淡化水，現今的RO技術已非常成熟，能高效濾除海水中的大部分鹽分、離子、雜質，甚至細菌和病毒。北區水資源分署(以下簡稱北水分署)於新竹市南寮漁港南側興辦新竹海水淡化廠工程，採用逆滲透過濾海水產製純淨淡水，日產水量可達10萬噸，成為全國首座由政府興辦之大型海水淡化廠。
新竹海淡廠在海水取水端引入了創新設計，採用清管器來清除取水管線內之異物，以避免營運階段管線內滋生障礙物影響取水能力，相較於傳統海淡廠在取水處加氯清除的方式，對環境更加友善。除取水端創新設計外，新竹海淡廠更採用了國外成熟前處理技術，以氣浮設施(DAF)及雙介質過濾器(DMPF)以取代我國離島海淡廠採用之超過濾設備(UF)，故不須定期更換薄膜，大幅減少廢棄物產生，且清洗時不須添加化學藥劑，減少對環境衝擊。另因應全球暖化影響導致潛在的藻類增生議題，利用氣浮設施(DAF)及雙介質過濾設備(DMPF)的前處理組合可以更有效地去除。
新竹海水淡化廠工程於113年7月發包，已於114年5月16日舉行開工典禮，預計117年3月完工正式進入運轉供水。本海淡廠於完工後，將可挹注新竹地區自有水源，並可與既有寶山、寶二級隆恩堰水庫聯合運用，維持水庫更長時間高水位以滿足用水需求，並減少石門水庫跨區輸水壓力，有助於提升新竹地區未來因應枯旱更具供水韌性，新竹地區民眾及產業是最大受益者。