近年來因氣候變遷的影響,造成水域的關注物種棲地受到干擾、破壞甚至是喪失。其中,巴氏銀鮈屬於瀕臨絕種野生動物,據臺中市野生動物保育學會調查目前穩定分布在烏溪橋下游至與貓羅溪匯流處河段,第三河川分署為加強巴氏銀鮈保育避免河川治理工程影響棲地,並與農業部林業及自然保育署等相關單位合作,除持續維護既有棲地外,同時也朝擴展其潛在棲地與進行域外保育努力。
第三河川分署於民國111年以工程手段復原烏溪溪尾大橋右岸巴氏銀鮈之原有棲地1.1公里並進行巴氏銀鮈回放,另經委外計畫探討評估規劃,初步盤點出巴氏銀鮈2處可能潛在棲地、3處域內庇護池,亦於民國112年完成2處域外庇護池,並經保育主管機關同意作為乾涸河段魚隻營救暫時性庇護場域。
第三河川分署與臺中市野生動物保育學會針對「烏溪瀕危淡水魚類保育」簽訂合作意向書,在復原棲地與庇護池之管理、乾涸河段營救、回放作業、生態監測等工作進行合作。
烏溪溪尾大橋右岸復原棲地當初回放巴氏銀鮈20隻,民國111年8月~民國113年4月陸續都有紀錄到該魚種,監測到之最大數量為42隻。自烏溪乾涸河段搶救之巴氏銀鮈112及113年度分別為75隻及45隻,其中有45隻暫時放入位於三河分署庇護池,魚隻放入後有自然繁殖,巴氏銀鮈第三河川分署庇護池,目前保守初估約有800隻,豐水期來臨後會將魚隻回放烏溪水域內。